Стоимость товара в его карточке влияет только на продажную цену на кассовом терминале.
Себестоимость определяется лишь приходными документами.
Если в отчетах себестоимость равна нулю, то данная ситуация могла возникнуть в следующих случаях:
Товар не был оприходован в системе или был принят с нулевой ценой. Решение: создайте документ Поступление, если его не было в системе. Или укажите цену за единицу товара в существующем документе. Подробнее о создании и редактировании документа читайте в статье Поступления.
Проверьте, что документ Поступление находится в статусе Активен.