Флаг «Загружать входящие СФ» позволит загрузить из Store House в 1С входящие счета-фактуры.
Флаг «Загружать исходящие СФ» позволит загрузить из Store House в 1С исходящие счета-фактуры.

Для авансовых платежей счета-фактуры не выгружаются.