Фильтр по складам разделен на две части. Верхняя часть «Склады» - в данной части отображаются подразделения Store House, соответствующие выбранной в настройках организации Store House. В нижней части «Предприятие» - отображены все предприятия Store House. Предприятия, соответствующие выбранной в настройках организации, выделены жирным шрифтом.
Выставьте флаг «Использовать фильтр по складам», если из Store House в 1С необходимо выгружать документы по определенным подразделениям (складам).
Список подразделений из Store House подгружается в момент открытия файла выгрузки. После выставления флага «Использовать фильтр по складам» сами склады станут доступны для фильтрации списка документов.
Выставьте флаги у тех подразделений, по которым выводить список документов для загрузки. В список попадут только те документы, у которых выделенное подразделение (подразделения) указано в качестве поставщика или получателя.
Если для выгрузки из Store House в 1С необходимо выбрать подразделения одного предприятия, выставьте флаг в нижней части напротив нужного предприятия, склады будут определены автоматически.
Если флаг «Использовать фильтр по складам» не выставлен, то при загрузке будет выведен список всех накладных, доступных пользователю в Store House.

Фильтры по складам не сохраняются при закрытии формы или сохранении настроек. Т.е. флаги по складам необходимо проставлять непосредственно перед формированием списка документов для загрузки.